Podczas Powstania Warszawskiego była magazynierką i sanitariuszką. W konspiracji była od października 1943 roku, działała w Szarych Szeregach. Podczas powstania dostała przydział do Sanitariatu Okręgu Warszawskiego Armii Krajowej – najpierw pracowała w szpitalu polowym przy ul. Śniadeckich 21, a po jego zbombardowaniu w szpitalu na ul. Marszałkowskiej 65. Brat Marii Gepner Bolesław Gepner ps. "Jasnotek", łącznik Harcerskiej Poczty Polowej poległ w sierpniu 1944 roku na ul. Lwowskiej trafiony kulą niemieckiego snajpera. Jej ojciec, mec. Bolesław Marek Gepner (1896 - 1944), adwokat, został w 1944 roku rozstrzelany przez gestapo. Matka Stefania Gepner ps. „Anna” w czasie Powstania Warszawskiego pełniła służbę w Szpitalu Polowym na ul. Śniadeckich 21 i Marszałkowskiej 65 jako PŻ („Pomoc Żołnierzom”). Dziadek dr Bolesław Ryszard Gepner (1864-1923) był znanym i cenionym lekarzem okulistą, ordynariuszem i prezesem Polskiego Instytutu Oftalmicznego w Warszawie. oraz - obok hr. Róży Marii Czackiej (znanej później jako Matka Elżbieta Róża Czacka) - jednym z członków założycieli Towarzystwa Opieki nad Ociemniałymi w Laskach. Natomiast ciocią Marii była harcmistrzyni Rzeczypospolitej Helena Gepnerówna Śliwowska Grażyńska. Niezwykłą pamiątkę rodzinną - przestrzeloną i zakrwawioną koszulę młodszego brata - łącznika „Jasnotka” przekazała do zbiorów Muzeum Powstania Warszawskiego. Obecnie koszula prezentowana jest na ekspozycji stałej MPW w sali poświęconej Harcerskiej Poczcie Polowej. Po wojnie była architektem w Biurach Projektów i Instytucie Urbanistyki i Architektury.